20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6292 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6292  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1811  hypothetical protein  94.29 
 
 		 280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  79.27 
 
 		 276 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  38.78 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1724  hypothetical protein  66.07 
 
 		 98 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  43.14 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  49.23 
 
 		 497 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  38.75 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  43.33 
 
 		 479 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  43.24 
 
 		 446 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  37.65 
 
 		 341 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  36.17 
 
 		 434 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  42.37 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  44.07 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  30 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.15 
 
 		 122 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  30.95 
 
 		 136 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>