20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5088 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1811  hypothetical protein  80.22 
 
 
280 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6292  hypothetical protein  79.27 
 
 
280 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.320647  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1787  hypothetical protein  79.27 
 
 
280 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  39.69 
 
 
314 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1724  hypothetical protein  68.85 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933562  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  43.56 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  37.78 
 
 
434 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  44.59 
 
 
446 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  46.15 
 
 
497 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.29 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  34.07 
 
 
122 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  40 
 
 
557 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  32.41 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  38.1 
 
 
479 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  38.98 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  40.68 
 
 
225 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4397  tetratricopeptide TPR_2  34.31 
 
 
253 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.74 
 
 
315 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>