71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1150 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  33.88 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  39.18 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  38.95 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  40.43 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  38.64 
 
 		 211 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  36.89 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  34.57 
 
 		 351 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  33.04 
 
 		 446 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  32.98 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  36.47 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.71 
 
 		 306 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  40.51 
 
 		 497 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  36.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  36.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  30.49 
 
 		 307 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  33.01 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  30.11 
 
 		 339 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  30.69 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.29 
 
 		 262 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  34.74 
 
 		 277 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  28.75 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  31.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  29.7 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  34.83 
 
 		 275 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  33.75 
 
 		 479 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  27.96 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  32.22 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  30.91 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  29.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  34.83 
 
 		 390 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  34.83 
 
 		 373 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  34.83 
 
 		 371 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  34.07 
 
 		 276 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  32.53 
 
 		 193 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  34.83 
 
 		 406 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  34.83 
 
 		 377 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  34.83 
 
 		 385 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  30.59 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  32.93 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.71 
 
 		 436 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  34.44 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30.84 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  27.62 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  33.73 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  30.49 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  31.52 
 
 		 280 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  36.47 
 
 		 339 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  27.55 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  27.78 
 
 		 333 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  32.91 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  34.48 
 
 		 413 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  33.71 
 
 		 418 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  41.51 
 
 		 877 aa  40.4  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  32.18 
 
 		 244 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 295 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  30.69 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  28.05 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  32.18 
 
 		 244 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  28.26 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>