46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4134 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  80.58 
 
 		 307 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1577  hypothetical protein  40.24 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0247131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3802  hypothetical protein  40.88 
 
 		 370 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328147 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0012  hypothetical protein  36.09 
 
 		 352 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  40.62 
 
 		 479 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  36.56 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  34.38 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  34.09 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.87 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.26 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  34.31 
 
 		 877 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  39.53 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  41.46 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  40.62 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  35.35 
 
 		 462 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  37.66 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  32.26 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.95 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  35.96 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  34.57 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  30.1 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  37.18 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  37.7 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  35.44 
 
 		 463 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  32.97 
 
 		 132 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  35.44 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  32 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  36.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.69 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  32.41 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  31 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0619  hypothetical protein  25.88 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  36.71 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  37.66 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  36.71 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  36.71 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0699  hypothetical protein  25.88 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.951363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  32.53 
 
 		 557 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  29.7 
 
 		 109 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  34.72 
 
 		 254 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>