58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0482 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  55.81 
 
 		 134 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  48.46 
 
 		 134 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  50.39 
 
 		 135 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  47.33 
 
 		 134 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  46.56 
 
 		 134 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  48.21 
 
 		 134 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  44.62 
 
 		 135 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  51.35 
 
 		 138 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  47.24 
 
 		 135 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  39.23 
 
 		 136 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  42.5 
 
 		 131 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  42.5 
 
 		 131 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  42.5 
 
 		 131 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  42.5 
 
 		 131 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  42.5 
 
 		 131 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  42.74 
 
 		 144 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  34.68 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  34.26 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  37.29 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  36.44 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  28.03 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  34.11 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  35.66 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  33.67 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  32 
 
 		 128 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  30.84 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.96 
 
 		 130 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  32 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  27.91 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  32.69 
 
 		 136 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  32.8 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  32 
 
 		 136 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  33.59 
 
 		 148 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  27.36 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  28.77 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  47.92 
 
 		 501 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  30.66 
 
 		 140 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  30.84 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1462  hypothetical protein  41.54 
 
 		 314 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661828  hitchhiker  0.000296073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  27.46 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  29.77 
 
 		 129 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  26.06 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  31.43 
 
 		 129 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  38.67 
 
 		 462 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  37.93 
 
 		 463 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  36.21 
 
 		 153 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>