61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3309 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 
135 aa  275  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  89.63 
 
 
135 aa  254  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  57.81 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  47.15 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  34.38 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  38.58 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  38.58 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  38.58 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  35.43 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  34.96 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  33.04 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  36.8 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  36 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  37.86 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  37.61 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  30.58 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  37.76 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  37.74 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  39.6 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  38.76 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  33.03 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  32.54 
 
 
136 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  36.43 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  38.24 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  30 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  31.45 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  32.59 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  42.7 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  32.63 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  32.63 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  26.83 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.05 
 
 
170 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  31.82 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.07 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  32.63 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  26.47 
 
 
251 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  39.76 
 
 
129 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  39.76 
 
 
129 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  29.55 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  35.14 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2822  hypothetical protein  24.58 
 
 
485 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.79 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  28.46 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4008  hypothetical protein  41.3 
 
 
417 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  29.25 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  29.25 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  26.15 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  22.52 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  31.09 
 
 
251 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1079  protein of unknown function DUF1311  27.45 
 
 
167 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.523382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>