64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0821 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  98.44 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  78.12 
 
 		 128 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  45.83 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  45.1 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  40.57 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  33.59 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  34.62 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.9 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  29.46 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  38.54 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  30.53 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  30.21 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  29.92 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  39.76 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  36.46 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  35.35 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  31.5 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  33.01 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  33.7 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  33.01 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  32.52 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  30.97 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  32.54 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  26.36 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  30.85 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.35 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.35 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.35 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.35 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.35 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  27.73 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  32.63 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  31.3 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  30.1 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  32.56 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  36.9 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  26.88 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  31.58 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  32.95 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  28.87 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  30 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4005  protein of unknown function DUF1311  29.59 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.575845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3892  hypothetical protein  29.59 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  31.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  39.13 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  32 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  27.84 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  25.53 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  26.6 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  29.21 
 
 		 162 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  29 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>