71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4365 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  78.91 
 
 		 128 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  78.12 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  76.56 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  46.53 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  41.51 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  35.42 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  35.77 
 
 		 293 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  30.65 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  34.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  34.4 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  33.07 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  35.48 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  43.59 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  30.83 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  37.08 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  32.74 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  34.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  33.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  38.1 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  34.78 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  35.23 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  36.67 
 
 		 134 aa  57  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  34.48 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  33.01 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  28.35 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  26.15 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  32.97 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  32.99 
 
 		 251 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  32.95 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  30.43 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  30.43 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  30.43 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  30.43 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  35.71 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  31.82 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  34.74 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  31.96 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  29.69 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  28.72 
 
 		 153 aa  48.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  29 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  25.42 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  35 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  28.72 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  29.07 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  26.09 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  27.59 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4005  protein of unknown function DUF1311  28.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.575845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  30.67 
 
 		 501 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0818  hypothetical protein  32.97 
 
 		 181 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  26.42 
 
 		 162 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  25.47 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  25.47 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  25.47 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  25.47 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  25.47 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  29.21 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  26.26 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>