58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3576 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 152 aa  313  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  81.05 
 
 		 153 aa  229  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  31.09 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  31.09 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0716  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.674461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1610  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1065  hypothetical protein  27.72 
 
 		 240 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1059  hypothetical protein  27.72 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2989  hypothetical protein  27.72 
 
 		 242 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2297  hypothetical protein  27.72 
 
 		 242 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.41 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0862  hypothetical protein  27.72 
 
 		 238 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00844631  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0863  hypothetical protein  30.93 
 
 		 265 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  30.83 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  43.4 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3476  hypothetical protein  32.11 
 
 		 243 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  39.58 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  39.58 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  39.58 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  33.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5762  hypothetical protein  29.9 
 
 		 279 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  32.56 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  29 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  45.76 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2431  hypothetical protein  32.39 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1021  hypothetical protein  29.55 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.618094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1820  hypothetical protein  32.39 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297169  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2436  hypothetical protein  28.87 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16266  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2478  hypothetical protein  32.39 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2344  hypothetical protein  32.39 
 
 		 276 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.195051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  26.92 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  24.81 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  25.84 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  25.25 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  29.31 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  28.26 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  29.31 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  30.93 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  26.32 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  25.98 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2185  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0390408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  25.25 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  23.48 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  29.89 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1217  hypothetical protein  24.21 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  41.03 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  36.21 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  39.71 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>