39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2187 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  34.62 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  34.13 
 
 
128 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  37.04 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  32.22 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  32.22 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.37 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  38.46 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  34.57 
 
 
293 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.08 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  34.25 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  30.08 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  30.08 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  30.08 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  30.08 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  28.57 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  28.74 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.29 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  29.27 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  27.35 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  28.09 
 
 
128 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  30.59 
 
 
129 aa  47.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  30.59 
 
 
142 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  29.03 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  26.52 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  28.67 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  28.09 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  30.49 
 
 
131 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  31.17 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  28.05 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
193 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  31.25 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  33.9 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>