26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0554 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  56.45 
 
 
137 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  38.93 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  33.59 
 
 
136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  35.77 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  34.21 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.05 
 
 
170 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32930  hypothetical protein  25.19 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126149 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  38.89 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2800  hypothetical protein  24.09 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  34.57 
 
 
134 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  33.94 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  26.47 
 
 
170 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  32.71 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  25.74 
 
 
164 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  28.74 
 
 
119 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  26.09 
 
 
164 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  35.71 
 
 
135 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.14 
 
 
133 aa  45.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  26.92 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  34.09 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  31.46 
 
 
140 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  26.92 
 
 
153 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  33.73 
 
 
134 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>