14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0885 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  87.55 
 
 		 258 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3920  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  32.71 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.76 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.76 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.76 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.76 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.76 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  29.79 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  28.09 
 
 		 131 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  31.45 
 
 		 137 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  28.89 
 
 		 134 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>