85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1217 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  99.24 
 
 
131 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  99.24 
 
 
131 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  99.24 
 
 
131 aa  263  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  98.47 
 
 
131 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  74.05 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  46.56 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  43.65 
 
 
134 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  47.27 
 
 
134 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  43.65 
 
 
134 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  42.31 
 
 
135 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  42.52 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  44.55 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  38.28 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  43.48 
 
 
226 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  36.72 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  42.96 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  39.6 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  38.84 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  40.18 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  34.13 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  35.24 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  39.17 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  36.8 
 
 
135 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  38.84 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  34.78 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  32.8 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  36.05 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  32.28 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.98 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  32.54 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  29.46 
 
 
251 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  29.35 
 
 
136 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  29.35 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  30.08 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  29.55 
 
 
258 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  30.43 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  30.7 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  29.67 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  29.75 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  28.26 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  30.21 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  33.33 
 
 
333 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  32.29 
 
 
129 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  29.76 
 
 
258 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  40.38 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  39.58 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  29.81 
 
 
140 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  32.26 
 
 
148 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  33.01 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  29.27 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  36.71 
 
 
309 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  28.1 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  27.2 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  27.87 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  28.1 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0963  protein of unknown function DUF1311  30.59 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  32.91 
 
 
307 aa  42  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  31.17 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  26.21 
 
 
129 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  27.2 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1812  protein of unknown function DUF1311  29 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  26.04 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2008  hypothetical protein  29 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  30.12 
 
 
497 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  28.89 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  28.89 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  31.76 
 
 
126 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>