34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0112 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  39.26 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  36.04 
 
 		 251 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  32.08 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  33.02 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  34.91 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  34.13 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  33.02 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  33.02 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  32.08 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  31.13 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  28.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  30.19 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.08 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  30.08 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  30.08 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  30.08 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  25.2 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.27 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  34.74 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  24.59 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  31.91 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  30.95 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  30.68 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.5 
 
 		 135 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  37.25 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>