15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0330 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  72.18 
 
 		 143 aa  206  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  71.43 
 
 		 138 aa  205  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  74.44 
 
 		 138 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  38.17 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  42.54 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  38.24 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  29.52 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  23.14 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  27.69 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  29.09 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3742  hypothetical protein  25.58 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  28.04 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>