18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5226 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  61.76 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  60.29 
 
 		 136 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  42.54 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  43.94 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  42.42 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  40.3 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  32.08 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  37.89 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  28.35 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  27.56 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  26.32 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  29.63 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  34.57 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  30.1 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>