68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2321 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  39.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  38.71 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  44.25 
 
 
226 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  36.43 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  38.28 
 
 
134 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  38.28 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  40.91 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  37.07 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  37.72 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  40.16 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  40.16 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  40.37 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  40.37 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  40.37 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  34.96 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  37.63 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  39.33 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  37.62 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  35.45 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  34.38 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  39.23 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  37.69 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  33.67 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  36 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  35.51 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  35.24 
 
 
128 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  34.85 
 
 
140 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  34.26 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  31.54 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  29.47 
 
 
205 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  33.68 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  31.97 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4008  hypothetical protein  31.25 
 
 
417 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  29.03 
 
 
251 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  29.23 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  27.34 
 
 
143 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  30.69 
 
 
138 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  31.97 
 
 
128 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  33.33 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  33.64 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2008  hypothetical protein  32.26 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  32.26 
 
 
152 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1812  protein of unknown function DUF1311  31.18 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  29.7 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2603  hypothetical protein  31.11 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105588  normal  0.589316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.66 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  29.07 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  27.56 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  28.95 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  32.61 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  35.64 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  31 
 
 
129 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  41.82 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  32.5 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  32.5 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1079  protein of unknown function DUF1311  26.92 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.523382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  28.7 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  28 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  31.48 
 
 
333 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>