55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1738 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  346  7e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  32.23 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  32.23 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  34.88 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  35.9 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  41.38 
 
 
128 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  44.32 
 
 
126 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  42.05 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  36.05 
 
 
131 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  37.08 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  39.08 
 
 
137 aa  58.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  35.05 
 
 
293 aa  58.2  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  39.24 
 
 
119 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  36.05 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  36.05 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  36.05 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  36.05 
 
 
131 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  36.05 
 
 
131 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  39.08 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  33.68 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  35.56 
 
 
143 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  34.48 
 
 
130 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  33.68 
 
 
134 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  35.05 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  31.31 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  33.72 
 
 
135 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  43.4 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  43.4 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  29.9 
 
 
136 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  31.96 
 
 
135 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  35.8 
 
 
134 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  34.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  25.93 
 
 
258 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  28.18 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  34.09 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  28.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  32.35 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  34.34 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  31.33 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  35.23 
 
 
134 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  32.95 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  32.95 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  32.95 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  31.4 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3920  putative lipoprotein  27.14 
 
 
385 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  32.97 
 
 
128 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1841  hypothetical protein  29.58 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304694  normal  0.532722 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  27.06 
 
 
258 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>