57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3773 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  97.01 
 
 		 134 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  91.04 
 
 		 134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  86.57 
 
 		 134 aa  238  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  86.57 
 
 		 134 aa  238  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  85.82 
 
 		 134 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  78.52 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  46.92 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  48.84 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  45.04 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  47.86 
 
 		 226 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  48.72 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  47.41 
 
 		 136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  40.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  47.24 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  42.86 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  42.86 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  42.86 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  42.86 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  40.91 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  31.2 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  34.65 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  37.12 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  37.61 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  36.75 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  34.31 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  36.67 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  35.51 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  34.44 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  30.36 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  34.02 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  31.13 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  35.63 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  29.46 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.95 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.8 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  30.39 
 
 		 251 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  45 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  30.3 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  30.3 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  28.28 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  39.47 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  42.22 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  26.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  25.56 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  36.92 
 
 		 293 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  22.34 
 
 		 405 aa  40  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  28.15 
 
 		 138 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>