66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4003 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  97.76 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  92.54 
 
 		 134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  86.57 
 
 		 134 aa  238  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  85.07 
 
 		 134 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  80.74 
 
 		 135 aa  216  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  54.17 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  48.46 
 
 		 135 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  47.33 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  48.87 
 
 		 226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  49.57 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  39.55 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  45.93 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  46.56 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  45.53 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  45.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  43.65 
 
 		 131 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  43.65 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  43.65 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  43.65 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  43.64 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  39.06 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  35.43 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  36.13 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  37.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  36.64 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  32.26 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  39.23 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  38.58 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  34.31 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  34.4 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  33.98 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  33.02 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  33.01 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  30.89 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  35.51 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  31.43 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  27.82 
 
 		 251 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  28.3 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  34.62 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  44.44 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  28.12 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  30.09 
 
 		 251 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  34.07 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  32.95 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  25.45 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  27.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  27.35 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  25.45 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  27.41 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  26.5 
 
 		 162 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  44.44 
 
 		 501 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  32.53 
 
 		 293 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1663  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  26.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  26.67 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>