46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5211 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  97.71 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  48.21 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  30.91 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  31.62 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  29.52 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  33.93 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  30.16 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  30.17 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  32.54 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  31.75 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  31.75 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  31.75 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  31.78 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  28.97 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.57 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  30.09 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  33.04 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  26.4 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  28.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  30.84 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  26.67 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  29.91 
 
 		 136 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  25.45 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  25.45 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  34.21 
 
 		 126 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  29.73 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  27.1 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  27.1 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  32.05 
 
 		 179 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  24.81 
 
 		 135 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>