43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_p08272 on replicon NC_009777
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  273  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  99.22 
 
 		 129 aa  270  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  32.2 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  31.36 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  31.36 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  34.34 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  30.77 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  38.82 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  33.67 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  32.74 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  39.76 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  39.76 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  28.18 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  30.3 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  27.87 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  26.45 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  32.89 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  27.78 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  27.78 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  27.87 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  28.46 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  25.25 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  27.5 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  32.1 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  29.2 
 
 		 136 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  32.26 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  27.1 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  23.96 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  31.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  27.1 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>