24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0956 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 164 aa  336  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  78.66 
 
 		 170 aa  268  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  77.44 
 
 		 164 aa  265  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  34.75 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  35.54 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  35.35 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.19 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  34.34 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  27.83 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  32.86 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  25.27 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  29.03 
 
 		 293 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0299  hypothetical protein  27.55 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.773031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  30 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  32.29 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  32.76 
 
 		 153 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  40.8  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>