75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1480 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  50 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  49.22 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  50 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  45.31 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  44 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  48.21 
 
 		 134 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  48.03 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  44.7 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  47.24 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  45.53 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  45.53 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  42.59 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  42.98 
 
 		 226 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  37.3 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  39.64 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  38.17 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  36.27 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  41.46 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  36.27 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  38.52 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  38.68 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  32.74 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  35.05 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  41.38 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  33.03 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  33.03 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  32.5 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  32.48 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.18 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  31.67 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4008  hypothetical protein  32.22 
 
 		 417 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2403  hypothetical protein  29.59 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  29.32 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.61 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  28.45 
 
 		 462 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  36.14 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  28.97 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  25.24 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  26.4 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  28.95 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  25.2 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  26.4 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  32.89 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  32.56 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  31.11 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  29.03 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  29.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  29.63 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  28.05 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  27.69 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  25.66 
 
 		 877 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  25.44 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  25.42 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  33.85 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  31 
 
 		 333 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  32.84 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  25.23 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  33.75 
 
 		 309 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  31 
 
 		 133 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>