27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2137 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  97.66 
 
 
128 aa  214  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  62.3 
 
 
129 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  64.81 
 
 
129 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  60 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  58.1 
 
 
129 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  58.1 
 
 
129 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  56.48 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  39.67 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  38.14 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  33.03 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  33.03 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  33.03 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  33.03 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  33.03 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  31.93 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  31.93 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  35.23 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  33.91 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  31.65 
 
 
133 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  32.53 
 
 
135 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  35.23 
 
 
135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  38.3 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>