32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5390 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  97.67 
 
 
129 aa  236  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  97.67 
 
 
129 aa  236  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  88.37 
 
 
129 aa  214  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  79.84 
 
 
129 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  82.17 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  57.84 
 
 
128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  57.84 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  38.71 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  37.11 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  31.86 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  31.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  31.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  31.86 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  31.86 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  38.05 
 
 
341 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  29.23 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  29.23 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  31.31 
 
 
226 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  31.87 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  32.5 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  26.83 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3382  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.814111  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  31.9 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  37.5 
 
 
462 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  27.62 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  38.04 
 
 
334 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  29.41 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>