38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2912 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  39.62 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  38.68 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  38.68 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  35.14 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  35.85 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  34.91 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  28.91 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  35.44 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  30.25 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  30.25 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  32.61 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.27 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  32.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  31.15 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  34.88 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  39.76 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  34.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>