61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1653 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  91.04 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  92.54 
 
 
134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  92.54 
 
 
134 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  89.55 
 
 
134 aa  249  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  91.79 
 
 
134 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  82.22 
 
 
135 aa  224  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  52.07 
 
 
134 aa  137  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  47.69 
 
 
135 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  46.56 
 
 
135 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  50 
 
 
226 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  49.57 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  46.67 
 
 
136 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  48.48 
 
 
135 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  48.21 
 
 
128 aa  106  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  38.06 
 
 
134 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  43.64 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  44.55 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  44.55 
 
 
131 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  44.55 
 
 
131 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  44.55 
 
 
131 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  44.55 
 
 
131 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  38.28 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  33.04 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  37.12 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  36.75 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  36.75 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  36.84 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  35.92 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  33.04 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  33.33 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  34.11 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  36.08 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  31.78 
 
 
129 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  34.83 
 
 
153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  32.08 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  32.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  32.95 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  34.78 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  32.74 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  34.09 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  28.32 
 
 
251 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  33.7 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  26.4 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  25.66 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  44.44 
 
 
501 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  26.32 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  28.18 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  33.73 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1663  hypothetical protein  32.91 
 
 
137 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  29.73 
 
 
131 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  25.24 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  28.03 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  26.5 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  29.37 
 
 
140 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>