37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2382 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  34.45 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  32.28 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  28.91 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  29.77 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  30.4 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  35.19 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  25.95 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  25.56 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  27.03 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  31.73 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  29.69 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  29.32 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  26.83 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  27.78 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  44.9 
 
 
205 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  29.91 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  28.3 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  27.36 
 
 
226 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  30.77 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  30.77 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  30.77 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.81 
 
 
131 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  22.86 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  26.4 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0963  protein of unknown function DUF1311  28.36 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  32.74 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  30.09 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  26.47 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  25.49 
 
 
134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0036  hypothetical protein  29.1 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  26.67 
 
 
405 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>