15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0393 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  94.12 
 
 		 136 aa  267  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  60.29 
 
 		 133 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  39.69 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  36.64 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  36.64 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  33.02 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  30.09 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  30.91 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  32.63 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  27.1 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  30.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  32.84 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>