63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0365 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  57.89 
 
 		 226 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  46.62 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  40.15 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  39.55 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  39.55 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  41.98 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  40.15 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  38.81 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  40.46 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  38.06 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  43.31 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  44.96 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  45.95 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  37.3 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  40.37 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  36.72 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  35.94 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  35.94 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  35.94 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  35.94 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  37.12 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  39.85 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  33.63 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  34.65 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  30.23 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  36.29 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  38.24 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  32.65 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  31.07 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  30.17 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  25.56 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  28.93 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.96 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  28.89 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  32.71 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  28.79 
 
 		 251 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  21.74 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  32.94 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  35 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  30.1 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  24.59 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 501 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.23 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1663  hypothetical protein  25.19 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  32.88 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  26.45 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  26.45 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  26.36 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4008  hypothetical protein  28.72 
 
 		 417 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.21 
 
 		 463 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  27.64 
 
 		 205 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  29.82 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  27 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  34.48 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  40 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  35.59 
 
 		 413 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>