13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2677 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  28.77 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  27.59 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  25.74 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  27.82 
 
 		 134 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  31.58 
 
 		 134 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  26.47 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  28.79 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  26.32 
 
 		 134 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  29.31 
 
 		 226 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>