49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3481 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  280  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  57.03 
 
 		 135 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  57.81 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  45.95 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  37.61 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  29.75 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  34.26 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  35.83 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  35.92 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  35.48 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  30.23 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  30.4 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  34.58 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  30.47 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  33.98 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  32.69 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  35.51 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  34.58 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  26.36 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2677  protein of unknown function DUF1311  28.77 
 
 		 251 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.30219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  34.35 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  32.82 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  30.93 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  30.93 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1079  protein of unknown function DUF1311  29.29 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.523382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.97 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  31.53 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  31.53 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  31.53 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  32.14 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  29.9 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  32.04 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  22.86 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  29.9 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  31.45 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  23.97 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  28.68 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2822  hypothetical protein  25.86 
 
 		 485 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  28.44 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2403  hypothetical protein  29.7 
 
 		 229 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>