44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1843 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  85.94 
 
 		 128 aa  227  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  41.46 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  37.88 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  37.88 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  37.88 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  39.85 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  37.21 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  42.31 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  35.9 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  39.67 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  38.84 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  38.84 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  38.84 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  38.84 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  35.88 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  40.21 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  40.91 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  38.76 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  36.08 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  34.88 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  37.21 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  36.84 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  35.64 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  32.82 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  36.78 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1422  hypothetical protein  35 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  31.96 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  28.87 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  29.9 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  28.09 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  30.65 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  28.87 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  30.4 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  34.09 
 
 		 170 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  28.07 
 
 		 162 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>