62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4459 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  276  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  51.91 
 
 
134 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  47.1 
 
 
134 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  47.1 
 
 
134 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  43.85 
 
 
135 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  48.09 
 
 
134 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  47.1 
 
 
134 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  43.75 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  45.65 
 
 
134 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  43.7 
 
 
136 aa  115  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  51.35 
 
 
226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  44.62 
 
 
135 aa  105  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  44.27 
 
 
134 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  40.32 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  41.82 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  40.4 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  41.07 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  41.07 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  41.07 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  41.07 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  40.18 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  35.07 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  40.91 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  37.84 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  38.6 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  37.4 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  36.89 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  38.1 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  39.18 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  32.52 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  31.71 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  32.52 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  27.82 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  31.82 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  37.93 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  37.69 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  31.2 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  33.72 
 
 
137 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  35.63 
 
 
133 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4838  hypothetical protein  36.23 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2010  hypothetical protein  45.45 
 
 
501 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  34.44 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  27.56 
 
 
162 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  26.98 
 
 
162 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  29.52 
 
 
205 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  27.56 
 
 
162 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  27.56 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  27.78 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4785  hypothetical protein  29.75 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898894  normal  0.0913989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0299  hypothetical protein  30.49 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.773031  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  30.83 
 
 
140 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0393  hypothetical protein  29.55 
 
 
136 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>