26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3647 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3647  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  29.29 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  32.59 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  32.52 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  23.02 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  31.13 
 
 
226 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  30.1 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  32.41 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  27.1 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  25.89 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  34.15 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  28.81 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  28.81 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  28.81 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  28.81 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  26.28 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  29.37 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.25 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  31.39 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  31.13 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  27.27 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>