17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1763 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1763  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2109  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1755  hypothetical protein  99.38 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01837  hypothetical protein  98.77 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.832343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01848  hypothetical protein  98.77 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.738926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1972  hypothetical protein  97.53 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2614  hypothetical protein  96.3 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  29.27 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  28.3 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27.35 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  26.71 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  29.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  25.47 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>