29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0404 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0963  protein of unknown function DUF1311  32.2 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  34 
 
 
134 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  35.23 
 
 
131 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  32.97 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  30.21 
 
 
142 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  32.65 
 
 
135 aa  55.1  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  29.47 
 
 
144 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  30.19 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  32.95 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  44.9 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  32.95 
 
 
131 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  32.95 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  32.95 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  32.95 
 
 
131 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  31.78 
 
 
138 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  25.24 
 
 
128 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  26.47 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  26.47 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  34.15 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  27.59 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  31.4 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  29.52 
 
 
138 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  29.13 
 
 
134 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  32.1 
 
 
258 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  22.52 
 
 
135 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>