15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0997 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  87.55 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3920  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.55 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.55 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.55 
 
 		 131 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  32.71 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  32.53 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  34.15 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  29.63 
 
 		 130 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3370  protein of unknown function DUF1311  32.8 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  28.28 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  25.93 
 
 		 119 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>