63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1768 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  60.74 
 
 		 135 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  47.33 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  47.33 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  47.33 
 
 		 134 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  46.56 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  44.27 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  47.75 
 
 		 226 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  43.51 
 
 		 135 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  40.91 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  47.79 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  43.94 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  47.37 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  42.31 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  42.31 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  42.31 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  42.31 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  43.86 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  42.98 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  37.19 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  37.04 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  30.58 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2382  hypothetical protein  32.28 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377326  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  29.75 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  33.59 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  29.2 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3481  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0737  protein of unknown function DUF1311  34.31 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  30.89 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.25 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0404  hypothetical protein  32.97 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  33.01 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  29.27 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  29.27 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  33.67 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  35.48 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  31.58 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  30 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  34.15 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  34.15 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  28 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  30.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  29.79 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  36.59 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  27.42 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  25.98 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  27.78 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  32.93 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0112  hypothetical protein  27.5 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0494  hypothetical protein  24.03 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2822  hypothetical protein  25.53 
 
 		 485 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  28.21 
 
 		 251 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7248  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1812  protein of unknown function DUF1311  27.45 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2008  hypothetical protein  27.45 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.138138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>