19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1812 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1812  protein of unknown function DUF1311  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2008  hypothetical protein  99.3 
 
 		 142 aa  283  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2603  hypothetical protein  70.64 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105588  normal  0.589316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  56.31 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  40.43 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  31.18 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4008  hypothetical protein  32.74 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  29.51 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  31.93 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.51 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.51 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.51 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.51 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  27.17 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  27.45 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>