26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4896 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  97.67 
 
 
129 aa  235  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  80.62 
 
 
129 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  87.6 
 
 
129 aa  213  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  82.95 
 
 
129 aa  201  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  58.82 
 
 
128 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  58.82 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  38.71 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  37.11 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.09 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  29.57 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  29.57 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  29.57 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  29.57 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  35.4 
 
 
341 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  27.69 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  27.69 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  37.88 
 
 
194 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3382  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.814111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  32.5 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  28.97 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  28.93 
 
 
128 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>