30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4803 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4803  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4276  hypothetical protein  97.67 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.694315  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4896  hypothetical protein  82.95 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3470  hypothetical protein  82.95 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5390  hypothetical protein  82.17 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.653277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0813  hypothetical protein  79.84 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540849  normal  0.347559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24990  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.36403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2137  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0646  hypothetical protein  41.13 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.954432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2912  hypothetical protein  32.99 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176537  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  39.77 
 
 		 341 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  26.55 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  33.77 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  25.45 
 
 		 877 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  26.55 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  26.55 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  26.55 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  26.55 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  27.42 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0365  protein of unknown function DUF1311  39.39 
 
 		 194 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.832413  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  38.1 
 
 		 341 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.27 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  28.26 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3382  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.814111  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  24.49 
 
 		 700 aa  41.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  36.11 
 
 		 462 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  30.23 
 
 		 479 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  30.56 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  26.97 
 
 		 132 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>