45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0722 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1792    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  34.69 
 
 
341 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  35.42 
 
 
463 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  30.28 
 
 
315 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  62  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  33.67 
 
 
341 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.04 
 
 
479 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.02 
 
 
132 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  28.7 
 
 
446 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  34.31 
 
 
309 aa  55.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  30.33 
 
 
462 aa  53.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  30.68 
 
 
197 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  32.35 
 
 
307 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  30.84 
 
 
262 aa  52.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  30.77 
 
 
109 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  30.77 
 
 
109 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  30.77 
 
 
109 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  30.77 
 
 
109 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  30.77 
 
 
109 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  28.69 
 
 
222 aa  52  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  34.91 
 
 
111 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  30.77 
 
 
497 aa  51.2  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  35.87 
 
 
132 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  32.58 
 
 
214 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  28.7 
 
 
192 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  38.2 
 
 
123 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  30.3 
 
 
225 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  30.91 
 
 
257 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  27.87 
 
 
405 aa  48.1  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  28.04 
 
 
208 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  32.56 
 
 
225 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  28.95 
 
 
206 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.23 
 
 
277 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  32.94 
 
 
100 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  31.68 
 
 
254 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  31.76 
 
 
245 aa  46.2  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  26.38 
 
 
211 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  26.12 
 
 
557 aa  44.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  27.72 
 
 
266 aa  44.3  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>