54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4591 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  39.78 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  41.33 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  41.33 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  40.86 
 
 
222 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  41.33 
 
 
295 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  37.11 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  40 
 
 
413 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  33 
 
 
254 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.21 
 
 
436 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  41.46 
 
 
334 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.74 
 
 
315 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  34.48 
 
 
254 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  36.49 
 
 
570 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  38.57 
 
 
291 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  38.57 
 
 
291 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  38.57 
 
 
291 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  43.75 
 
 
341 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  32.74 
 
 
307 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  32.98 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.77 
 
 
277 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  30.69 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  35.23 
 
 
339 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  36.19 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.8 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  34.48 
 
 
266 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  30.85 
 
 
266 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  30.84 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  32.26 
 
 
231 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  27.78 
 
 
877 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  32.99 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  32.05 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  34.18 
 
 
339 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  30.65 
 
 
212 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  30.65 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  29.9 
 
 
262 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  28.75 
 
 
100 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  29.84 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  29.76 
 
 
306 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  32 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  32 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  32 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  32 
 
 
109 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  36.14 
 
 
405 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  33.33 
 
 
197 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  32.98 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.36 
 
 
446 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5088  hypothetical protein  29.63 
 
 
276 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>