40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1310 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  57.71 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  56.73 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  56 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  53.59 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  55.49 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  54.14 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  53.89 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  53.98 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  50.79 
 
 		 207 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  54.6 
 
 		 356 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  52.33 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  45.08 
 
 		 197 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  52.85 
 
 		 128 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  39.33 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  35.32 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  43.93 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  29.89 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  39.62 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  34.48 
 
 		 463 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  28.07 
 
 		 462 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.01 
 
 		 122 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  26.79 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  32.56 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  35.23 
 
 		 479 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  30.23 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  32.56 
 
 		 100 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  23.78 
 
 		 877 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  32.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  28.89 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  25.83 
 
 		 405 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.63 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  30.11 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  30.61 
 
 		 99 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  31.2 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  36.84 
 
 		 340 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>