38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2965 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  24.53 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  26.67 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  34.23 
 
 		 208 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  41.03 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  41.03 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  33.04 
 
 		 479 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  38.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  35.9 
 
 		 230 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  34.41 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  22.64 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  42.11 
 
 		 207 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  32.1 
 
 		 193 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  41.38 
 
 		 206 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  32.18 
 
 		 132 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  34.78 
 
 		 119 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  30.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  30.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  30.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  30.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  30.63 
 
 		 109 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 111 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  48.15 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32 
 
 		 446 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  33.9 
 
 		 122 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  42.42 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  30.19 
 
 		 211 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  27.85 
 
 		 277 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>