68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3593 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  27.69 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  27.19 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  36.27 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  44.87 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  39.22 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  39.56 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  46.91 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.65 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  39.22 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  43.59 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  38.96 
 
 		 339 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  39.44 
 
 		 122 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  29.51 
 
 		 251 aa  52.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  38.14 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  44.74 
 
 		 497 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  40.74 
 
 		 570 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  35.9 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  43.04 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  44.44 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  36 
 
 		 262 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  36.47 
 
 		 479 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  46.15 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  41.57 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  39.71 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  21.99 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  40 
 
 		 877 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  31.55 
 
 		 192 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  28.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  38.1 
 
 		 123 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37.66 
 
 		 111 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  38.57 
 
 		 117 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  37.65 
 
 		 166 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2372  hypothetical protein  38.71 
 
 		 658 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000121354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  22.09 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  30.67 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2414  hypothetical protein  34.33 
 
 		 643 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00418212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  39.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  34.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  34.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  34.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  34.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  34.04 
 
 		 109 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  34.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2828  hypothetical protein  32.93 
 
 		 557 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.899686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  35.8 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  22.09 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  35.8 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  29.47 
 
 		 197 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  37.5 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  35.8 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  21.86 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  41.18 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  26.02 
 
 		 361 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  32.14 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  29.25 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  37.68 
 
 		 356 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  34.43 
 
 		 463 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  35.82 
 
 		 206 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>