57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1146 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  31.28 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  28.99 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  33.16 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  29.86 
 
 
247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  29.86 
 
 
247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  31.75 
 
 
247 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  29.84 
 
 
247 aa  99  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  30.89 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  28.88 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  29.74 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  28.33 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  32.46 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  27.59 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  27.31 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  31.58 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  25.99 
 
 
333 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  27.16 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.38 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  29 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  30.53 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  27.91 
 
 
480 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  24.88 
 
 
418 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  23.75 
 
 
201 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  24 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  26.56 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  26.95 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  22.22 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  27.48 
 
 
370 aa  52.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  23.03 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  27.74 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  29.14 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  25.53 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  24.82 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  24.49 
 
 
265 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  24.14 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  25.17 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  25.41 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.83 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  23.64 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  21.86 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  25.87 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  25 
 
 
380 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  25.87 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  25.87 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  22.73 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  25.17 
 
 
335 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  25.45 
 
 
380 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  25.17 
 
 
248 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>