43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0466 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  30.83 
 
 
281 aa  97.1  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  29.5 
 
 
281 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  30.34 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  36.8 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  30.43 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  25.76 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  32.82 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  27.34 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  30.89 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  29.56 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  27.59 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  25.13 
 
 
370 aa  59.3  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  23.13 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  30.47 
 
 
322 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  30.33 
 
 
412 aa  55.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  27.69 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  29.06 
 
 
350 aa  52.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  22.54 
 
 
248 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  29.51 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  22.54 
 
 
248 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  23.03 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  25.36 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  23.74 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.98 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0874  hypothetical protein  26.95 
 
 
350 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000276029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  25.78 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  26.09 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  25.86 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  27.59 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  25.36 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  23.08 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  23.08 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  26.67 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  22.14 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  21.43 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  24.58 
 
 
210 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  24.35 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  22.22 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  22.96 
 
 
452 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  24.11 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>